Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms