Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q6DFW0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q6DFW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q6DFW0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q6DFW0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q6DFW0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q6DFW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q6DFW0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q6DFW0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q6DFW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q6DFW0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q6DFW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q6DFW0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q6DFW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q6DFW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q6DFW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q6DFW0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q6DFW0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q6DFW0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q6DFW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q6DFW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q6DFW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q6DFW0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q6DFW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Q6DFW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q6DFW0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q6DFW0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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