Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF43Q68DV7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF43Q68DV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF43Q68DV7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF43Q68DV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF43Q68DV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF43Q68DV7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF43Q68DV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF43Q68DV7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF43Q68DV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF43Q68DV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF43Q68DV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RNF43Q68DV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF43Q68DV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF43Q68DV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms