Protein–RNA interactions for Protein: Q68DA7

FMN1, Formin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMN1Q68DA7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
FMN1Q68DA7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
FMN1Q68DA7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
FMN1Q68DA7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
FMN1Q68DA7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
FMN1Q68DA7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
FMN1Q68DA7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
FMN1Q68DA7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
FMN1Q68DA7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
FMN1Q68DA7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
FMN1Q68DA7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
FMN1Q68DA7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
FMN1Q68DA7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
FMN1Q68DA7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
FMN1Q68DA7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
FMN1Q68DA7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
FMN1Q68DA7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
FMN1Q68DA7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
FMN1Q68DA7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
FMN1Q68DA7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
FMN1Q68DA7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
FMN1Q68DA7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
FMN1Q68DA7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
FMN1Q68DA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
FMN1Q68DA7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
FMN1Q68DA7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
FMN1Q68DA7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
FMN1Q68DA7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
FMN1Q68DA7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.03■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
FMN1Q68DA7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
FMN1Q68DA7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
FMN1Q68DA7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FMN1Q68DA7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
FMN1Q68DA7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
FMN1Q68DA7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
FMN1Q68DA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
FMN1Q68DA7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
FMN1Q68DA7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
FMN1Q68DA7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
FMN1Q68DA7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
FMN1Q68DA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
FMN1Q68DA7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
FMN1Q68DA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
FMN1Q68DA7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
FMN1Q68DA7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
FMN1Q68DA7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
FMN1Q68DA7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
FMN1Q68DA7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
FMN1Q68DA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
FMN1Q68DA7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
FMN1Q68DA7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
FMN1Q68DA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
FMN1Q68DA7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
FMN1Q68DA7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
FMN1Q68DA7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
FMN1Q68DA7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
FMN1Q68DA7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
FMN1Q68DA7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
FMN1Q68DA7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
FMN1Q68DA7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms