Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1Q66K80 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1Q66K80 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1Q66K80 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1Q66K80 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1Q66K80 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1Q66K80 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1Q66K80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1Q66K80 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1Q66K80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1Q66K80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1Q66K80 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1Q66K80 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms