Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup62Q63850 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup62Q63850 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup62Q63850 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup62Q63850 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup62Q63850 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62Q63850 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup62Q63850 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup62Q63850 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup62Q63850 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup62Q63850 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup62Q63850 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup62Q63850 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62Q63850 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62Q63850 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62Q63850 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62Q63850 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62Q63850 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62Q63850 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup62Q63850 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62Q63850 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms