Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps72Q62481 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps72Q62481 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps72Q62481 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps72Q62481 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps72Q62481 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps72Q62481 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps72Q62481 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps72Q62481 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps72Q62481 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps72Q62481 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps72Q62481 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps72Q62481 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps72Q62481 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps72Q62481 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps72Q62481 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Vps72Q62481 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps72Q62481 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps72Q62481 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps72Q62481 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps72Q62481 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps72Q62481 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Vps72Q62481 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps72Q62481 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps72Q62481 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps72Q62481 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps72Q62481 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps72Q62481 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps72Q62481 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps72Q62481 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms