Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vat1Q62465 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vat1Q62465 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vat1Q62465 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vat1Q62465 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vat1Q62465 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vat1Q62465 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vat1Q62465 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vat1Q62465 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vat1Q62465 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vat1Q62465 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vat1Q62465 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vat1Q62465 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vat1Q62465 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vat1Q62465 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vat1Q62465 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vat1Q62465 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vat1Q62465 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vat1Q62465 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vat1Q62465 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vat1Q62465 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vat1Q62465 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vat1Q62465 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vat1Q62465 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vat1Q62465 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vat1Q62465 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vat1Q62465 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vat1Q62465 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vat1Q62465 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms