Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sorbs1Q62417 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sorbs1Q62417 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sorbs1Q62417 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sorbs1Q62417 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sorbs1Q62417 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sorbs1Q62417 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sorbs1Q62417 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sorbs1Q62417 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sorbs1Q62417 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sorbs1Q62417 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sorbs1Q62417 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sorbs1Q62417 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sorbs1Q62417 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sorbs1Q62417 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sorbs1Q62417 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sorbs1Q62417 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sorbs1Q62417 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sorbs1Q62417 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sorbs1Q62417 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sorbs1Q62417 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sorbs1Q62417 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sorbs1Q62417 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sorbs1Q62417 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sorbs1Q62417 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sorbs1Q62417 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sorbs1Q62417 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sorbs1Q62417 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorbs1Q62417 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sorbs1Q62417 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sorbs1Q62417 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sorbs1Q62417 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sorbs1Q62417 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sorbs1Q62417 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms