Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
Kdm5dQ62240 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
Kdm5dQ62240 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
Kdm5dQ62240 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
Kdm5dQ62240 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC52.16■■■■■ 5.94
Kdm5dQ62240 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.16■■■■■ 5.94
Kdm5dQ62240 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
Kdm5dQ62240 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
Kdm5dQ62240 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC52.09■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
Kdm5dQ62240 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
Kdm5dQ62240 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
Kdm5dQ62240 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
Kdm5dQ62240 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
Kdm5dQ62240 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC51.94■■■■■ 5.91
Kdm5dQ62240 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
Kdm5dQ62240 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC51.89■■■■■ 5.9
Kdm5dQ62240 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC51.87■■■■■ 5.89
Kdm5dQ62240 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
Kdm5dQ62240 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
Kdm5dQ62240 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.84■■■■■ 5.89
Kdm5dQ62240 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC51.79■■■■■ 5.88
Kdm5dQ62240 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
Kdm5dQ62240 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
Kdm5dQ62240 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.75■■■■■ 5.88
Kdm5dQ62240 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
Kdm5dQ62240 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC51.74■■■■■ 5.87
Kdm5dQ62240 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
Kdm5dQ62240 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
Kdm5dQ62240 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
Kdm5dQ62240 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC51.64■■■■■ 5.86
Kdm5dQ62240 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
Kdm5dQ62240 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC51.6■■■■■ 5.85
Kdm5dQ62240 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
Kdm5dQ62240 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
Kdm5dQ62240 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC51.58■■■■■ 5.85
Kdm5dQ62240 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
Kdm5dQ62240 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
Kdm5dQ62240 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC51.52■■■■■ 5.84
Kdm5dQ62240 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC51.5■■■■■ 5.83
Kdm5dQ62240 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Kdm5dQ62240 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
Kdm5dQ62240 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Kdm5dQ62240 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
Kdm5dQ62240 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.43■■■■■ 5.82
Kdm5dQ62240 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC51.35■■■■■ 5.81
Kdm5dQ62240 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC51.32■■■■■ 5.81
Kdm5dQ62240 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
Kdm5dQ62240 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC51.24■■■■■ 5.79
Kdm5dQ62240 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
Kdm5dQ62240 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Kdm5dQ62240 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
Kdm5dQ62240 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC51.16■■■■■ 5.78
Kdm5dQ62240 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC51.14■■■■■ 5.78
Kdm5dQ62240 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC51.12■■■■■ 5.77
Kdm5dQ62240 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC51.06■■■■■ 5.76
Kdm5dQ62240 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
Kdm5dQ62240 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Kdm5dQ62240 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
Kdm5dQ62240 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
Kdm5dQ62240 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC50.97■■■■■ 5.75
Kdm5dQ62240 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
Kdm5dQ62240 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Kdm5dQ62240 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.89■■■■■ 5.74
Kdm5dQ62240 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
Kdm5dQ62240 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
Kdm5dQ62240 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
Kdm5dQ62240 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
Kdm5dQ62240 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
Kdm5dQ62240 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
Kdm5dQ62240 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.71
Kdm5dQ62240 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
Kdm5dQ62240 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC50.64■■■■■ 5.7
Kdm5dQ62240 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC50.55■■■■■ 5.68
Kdm5dQ62240 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
Kdm5dQ62240 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
Kdm5dQ62240 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC50.44■■■■■ 5.67
Kdm5dQ62240 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
Kdm5dQ62240 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
Kdm5dQ62240 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
Kdm5dQ62240 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
Kdm5dQ62240 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.35■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.65
Kdm5dQ62240 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC50.29■■■■■ 5.64
Kdm5dQ62240 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
Kdm5dQ62240 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Kdm5dQ62240 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms