Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx5Q61686 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx5Q61686 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx5Q61686 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx5Q61686 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx5Q61686 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx5Q61686 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx5Q61686 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx5Q61686 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx5Q61686 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx5Q61686 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx5Q61686 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx5Q61686 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx5Q61686 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms