Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vsx2Q61412 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vsx2Q61412 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsx2Q61412 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsx2Q61412 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vsx2Q61412 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vsx2Q61412 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vsx2Q61412 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vsx2Q61412 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vsx2Q61412 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vsx2Q61412 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vsx2Q61412 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vsx2Q61412 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vsx2Q61412 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsx2Q61412 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vsx2Q61412 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vsx2Q61412 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsx2Q61412 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vsx2Q61412 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsx2Q61412 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vsx2Q61412 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsx2Q61412 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsx2Q61412 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsx2Q61412 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx2Q61412 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsx2Q61412 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsx2Q61412 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsx2Q61412 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsx2Q61412 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsx2Q61412 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vsx2Q61412 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsx2Q61412 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms