Protein–RNA interactions for Protein: Q60860

Ltc4s, Leukotriene C4 synthase, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltc4sQ60860 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltc4sQ60860 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltc4sQ60860 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltc4sQ60860 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltc4sQ60860 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ltc4sQ60860 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ltc4sQ60860 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltc4sQ60860 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltc4sQ60860 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltc4sQ60860 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltc4sQ60860 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltc4sQ60860 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ltc4sQ60860 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ltc4sQ60860 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltc4sQ60860 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms