Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelnQ60841 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelnQ60841 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RelnQ60841 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelnQ60841 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelnQ60841 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RelnQ60841 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RelnQ60841 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RelnQ60841 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelnQ60841 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelnQ60841 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelnQ60841 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelnQ60841 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelnQ60841 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RelnQ60841 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RelnQ60841 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RelnQ60841 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RelnQ60841 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RelnQ60841 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RelnQ60841 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RelnQ60841 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelnQ60841 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelnQ60841 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RelnQ60841 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RelnQ60841 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RelnQ60841 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RelnQ60841 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelnQ60841 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelnQ60841 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelnQ60841 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelnQ60841 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelnQ60841 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelnQ60841 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelnQ60841 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RelnQ60841 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelnQ60841 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelnQ60841 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RelnQ60841 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RelnQ60841 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RelnQ60841 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelnQ60841 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RelnQ60841 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RelnQ60841 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelnQ60841 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RelnQ60841 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelnQ60841 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RelnQ60841 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelnQ60841 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RelnQ60841 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RelnQ60841 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms