Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ItgaeQ60677 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ItgaeQ60677 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ItgaeQ60677 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ItgaeQ60677 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ItgaeQ60677 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ItgaeQ60677 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ItgaeQ60677 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ItgaeQ60677 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ItgaeQ60677 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ItgaeQ60677 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ItgaeQ60677 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ItgaeQ60677 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ItgaeQ60677 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ItgaeQ60677 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ItgaeQ60677 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ItgaeQ60677 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ItgaeQ60677 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ItgaeQ60677 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ItgaeQ60677 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ItgaeQ60677 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ItgaeQ60677 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ItgaeQ60677 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ItgaeQ60677 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ItgaeQ60677 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ItgaeQ60677 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ItgaeQ60677 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgaeQ60677 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ItgaeQ60677 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ItgaeQ60677 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ItgaeQ60677 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms