Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClpbQ60649 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ClpbQ60649 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClpbQ60649 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClpbQ60649 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ClpbQ60649 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClpbQ60649 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClpbQ60649 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClpbQ60649 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClpbQ60649 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClpbQ60649 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClpbQ60649 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClpbQ60649 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClpbQ60649 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClpbQ60649 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ClpbQ60649 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClpbQ60649 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClpbQ60649 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClpbQ60649 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClpbQ60649 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms