Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BROXQ5VW32 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BROXQ5VW32 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BROXQ5VW32 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BROXQ5VW32 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BROXQ5VW32 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BROXQ5VW32 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BROXQ5VW32 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BROXQ5VW32 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BROXQ5VW32 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BROXQ5VW32 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BROXQ5VW32 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms