Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
MYOM3Q5VTT5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
MYOM3Q5VTT5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
MYOM3Q5VTT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
MYOM3Q5VTT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
MYOM3Q5VTT5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
MYOM3Q5VTT5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
MYOM3Q5VTT5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
MYOM3Q5VTT5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
MYOM3Q5VTT5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
MYOM3Q5VTT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
MYOM3Q5VTT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
MYOM3Q5VTT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
MYOM3Q5VTT5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
MYOM3Q5VTT5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.46
MYOM3Q5VTT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
MYOM3Q5VTT5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
MYOM3Q5VTT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
MYOM3Q5VTT5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
MYOM3Q5VTT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
MYOM3Q5VTT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
MYOM3Q5VTT5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
MYOM3Q5VTT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
MYOM3Q5VTT5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
MYOM3Q5VTT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
MYOM3Q5VTT5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
MYOM3Q5VTT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
MYOM3Q5VTT5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
MYOM3Q5VTT5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
MYOM3Q5VTT5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
MYOM3Q5VTT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
MYOM3Q5VTT5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MYOM3Q5VTT5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
MYOM3Q5VTT5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.38
MYOM3Q5VTT5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
MYOM3Q5VTT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
MYOM3Q5VTT5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
MYOM3Q5VTT5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
MYOM3Q5VTT5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
MYOM3Q5VTT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
MYOM3Q5VTT5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYOM3Q5VTT5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYOM3Q5VTT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYOM3Q5VTT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MYOM3Q5VTT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
MYOM3Q5VTT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYOM3Q5VTT5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYOM3Q5VTT5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYOM3Q5VTT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
MYOM3Q5VTT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
MYOM3Q5VTT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MYOM3Q5VTT5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYOM3Q5VTT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms