Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms