Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tdrd5Q5VCS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tdrd5Q5VCS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdrd5Q5VCS6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdrd5Q5VCS6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tdrd5Q5VCS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd5Q5VCS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd5Q5VCS6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd5Q5VCS6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd5Q5VCS6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tdrd5Q5VCS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tdrd5Q5VCS6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdrd5Q5VCS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tdrd5Q5VCS6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tdrd5Q5VCS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd5Q5VCS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tdrd5Q5VCS6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd5Q5VCS6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd5Q5VCS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd5Q5VCS6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd5Q5VCS6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tdrd5Q5VCS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tdrd5Q5VCS6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd5Q5VCS6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd5Q5VCS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tdrd5Q5VCS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd5Q5VCS6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd5Q5VCS6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms