Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf15Q5UBV8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf15Q5UBV8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms