Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMCO4Q5TGY1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMCO4Q5TGY1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMCO4Q5TGY1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMCO4Q5TGY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO4Q5TGY1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCO4Q5TGY1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCO4Q5TGY1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCO4Q5TGY1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCO4Q5TGY1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMCO4Q5TGY1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMCO4Q5TGY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMCO4Q5TGY1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO4Q5TGY1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO4Q5TGY1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms