Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PXDC1Q5TGL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PXDC1Q5TGL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms