Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGSNQ5TDP6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LGSNQ5TDP6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LGSNQ5TDP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGSNQ5TDP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGSNQ5TDP6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGSNQ5TDP6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LGSNQ5TDP6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGSNQ5TDP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGSNQ5TDP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGSNQ5TDP6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGSNQ5TDP6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGSNQ5TDP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGSNQ5TDP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGSNQ5TDP6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGSNQ5TDP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms