Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C6orf10Q5SRN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C6orf10Q5SRN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C6orf10Q5SRN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C6orf10Q5SRN2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C6orf10Q5SRN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C6orf10Q5SRN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C6orf10Q5SRN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C6orf10Q5SRN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C6orf10Q5SRN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf10Q5SRN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms