Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtp3Q5QGU6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp3Q5QGU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtp3Q5QGU6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtp3Q5QGU6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtp3Q5QGU6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtp3Q5QGU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtp3Q5QGU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtp3Q5QGU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtp3Q5QGU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp3Q5QGU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtp3Q5QGU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtp3Q5QGU6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtp3Q5QGU6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtp3Q5QGU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms