Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C3orf38Q5JPI3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C3orf38Q5JPI3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C3orf38Q5JPI3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C3orf38Q5JPI3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C3orf38Q5JPI3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C3orf38Q5JPI3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C3orf38Q5JPI3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C3orf38Q5JPI3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C3orf38Q5JPI3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C3orf38Q5JPI3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C3orf38Q5JPI3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C3orf38Q5JPI3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C3orf38Q5JPI3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C3orf38Q5JPI3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C3orf38Q5JPI3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C3orf38Q5JPI3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C3orf38Q5JPI3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C3orf38Q5JPI3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C3orf38Q5JPI3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms