Protein–RNA interactions for Protein: Q5I0V9

2900092C05Rik, RIKEN cDNA 2900092C05, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900092C05RikQ5I0V9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2900092C05RikQ5I0V9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
2900092C05RikQ5I0V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2900092C05RikQ5I0V9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2900092C05RikQ5I0V9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2900092C05RikQ5I0V9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2900092C05RikQ5I0V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
2900092C05RikQ5I0V9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
2900092C05RikQ5I0V9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2900092C05RikQ5I0V9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2900092C05RikQ5I0V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2900092C05RikQ5I0V9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2900092C05RikQ5I0V9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2900092C05RikQ5I0V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2900092C05RikQ5I0V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2900092C05RikQ5I0V9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2900092C05RikQ5I0V9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2900092C05RikQ5I0V9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2900092C05RikQ5I0V9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
2900092C05RikQ5I0V9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2900092C05RikQ5I0V9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms