Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9T9

FSCB, Fibrous sheath CABYR-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCBQ5H9T9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FSCBQ5H9T9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FSCBQ5H9T9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSCBQ5H9T9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FSCBQ5H9T9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSCBQ5H9T9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSCBQ5H9T9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSCBQ5H9T9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSCBQ5H9T9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FSCBQ5H9T9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FSCBQ5H9T9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSCBQ5H9T9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FSCBQ5H9T9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FSCBQ5H9T9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FSCBQ5H9T9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSCBQ5H9T9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms