Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CMPK2Q5EBM0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMPK2Q5EBM0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMPK2Q5EBM0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CMPK2Q5EBM0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CMPK2Q5EBM0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CMPK2Q5EBM0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CMPK2Q5EBM0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMPK2Q5EBM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMPK2Q5EBM0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CMPK2Q5EBM0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CMPK2Q5EBM0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMPK2Q5EBM0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms