Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC3LQ587J8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC3LQ587J8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC3LQ587J8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC3LQ587J8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC3LQ587J8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KHDC3LQ587J8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KHDC3LQ587J8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KHDC3LQ587J8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KHDC3LQ587J8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KHDC3LQ587J8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KHDC3LQ587J8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms