Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL12Q53G59 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL12Q53G59 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL12Q53G59 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL12Q53G59 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL12Q53G59 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL12Q53G59 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL12Q53G59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL12Q53G59 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL12Q53G59 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL12Q53G59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL12Q53G59 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL12Q53G59 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL12Q53G59 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL12Q53G59 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL12Q53G59 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL12Q53G59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms