Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Arap1Q4LDD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Arap1Q4LDD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Arap1Q4LDD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Arap1Q4LDD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Arap1Q4LDD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Arap1Q4LDD4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Arap1Q4LDD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Arap1Q4LDD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Arap1Q4LDD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Arap1Q4LDD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Arap1Q4LDD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Arap1Q4LDD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Arap1Q4LDD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arap1Q4LDD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arap1Q4LDD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arap1Q4LDD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Arap1Q4LDD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Arap1Q4LDD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Arap1Q4LDD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Arap1Q4LDD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Arap1Q4LDD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Arap1Q4LDD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Arap1Q4LDD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Arap1Q4LDD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Arap1Q4LDD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Arap1Q4LDD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Arap1Q4LDD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Arap1Q4LDD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Arap1Q4LDD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Arap1Q4LDD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Arap1Q4LDD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Arap1Q4LDD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Arap1Q4LDD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Arap1Q4LDD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Arap1Q4LDD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arap1Q4LDD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arap1Q4LDD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Arap1Q4LDD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Arap1Q4LDD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Arap1Q4LDD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Arap1Q4LDD4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms