Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700057G04RikQ3V0U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700057G04RikQ3V0U0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1700057G04RikQ3V0U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700057G04RikQ3V0U0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
1700057G04RikQ3V0U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700057G04RikQ3V0U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700057G04RikQ3V0U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700057G04RikQ3V0U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms