Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C3

Nutm2, NUT family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nutm2Q3V0C3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nutm2Q3V0C3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nutm2Q3V0C3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nutm2Q3V0C3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nutm2Q3V0C3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nutm2Q3V0C3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nutm2Q3V0C3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nutm2Q3V0C3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nutm2Q3V0C3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nutm2Q3V0C3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nutm2Q3V0C3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nutm2Q3V0C3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nutm2Q3V0C3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nutm2Q3V0C3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nutm2Q3V0C3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nutm2Q3V0C3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nutm2Q3V0C3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nutm2Q3V0C3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nutm2Q3V0C3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nutm2Q3V0C3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms