Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hipk4Q3V016 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hipk4Q3V016 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hipk4Q3V016 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hipk4Q3V016 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hipk4Q3V016 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hipk4Q3V016 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hipk4Q3V016 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hipk4Q3V016 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hipk4Q3V016 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hipk4Q3V016 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hipk4Q3V016 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hipk4Q3V016 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hipk4Q3V016 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hipk4Q3V016 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk4Q3V016 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms