Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ceacam12Q3UKP4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam12Q3UKP4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam12Q3UKP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ceacam12Q3UKP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ceacam12Q3UKP4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ceacam12Q3UKP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ceacam12Q3UKP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ceacam12Q3UKP4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ceacam12Q3UKP4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ceacam12Q3UKP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ceacam12Q3UKP4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ceacam12Q3UKP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ceacam12Q3UKP4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam12Q3UKP4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam12Q3UKP4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam12Q3UKP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam12Q3UKP4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms