Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm648Q3UJ22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm648Q3UJ22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm648Q3UJ22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm648Q3UJ22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm648Q3UJ22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm648Q3UJ22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm648Q3UJ22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm648Q3UJ22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm648Q3UJ22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm648Q3UJ22 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm648Q3UJ22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm648Q3UJ22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm648Q3UJ22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm648Q3UJ22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm648Q3UJ22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm648Q3UJ22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm648Q3UJ22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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