Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tmed8Q3UHI4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tmed8Q3UHI4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tmed8Q3UHI4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tmed8Q3UHI4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tmed8Q3UHI4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tmed8Q3UHI4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tmed8Q3UHI4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tmed8Q3UHI4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tmed8Q3UHI4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Tmed8Q3UHI4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tmed8Q3UHI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tmed8Q3UHI4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tmed8Q3UHI4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmed8Q3UHI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmed8Q3UHI4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tmed8Q3UHI4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tmed8Q3UHI4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tmed8Q3UHI4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tmed8Q3UHI4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tmed8Q3UHI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmed8Q3UHI4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tmed8Q3UHI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tmed8Q3UHI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmed8Q3UHI4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tmed8Q3UHI4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Tmed8Q3UHI4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tmed8Q3UHI4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tmed8Q3UHI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Tmed8Q3UHI4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Tmed8Q3UHI4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmed8Q3UHI4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmed8Q3UHI4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmed8Q3UHI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmed8Q3UHI4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tmed8Q3UHI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmed8Q3UHI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmed8Q3UHI4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tmed8Q3UHI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmed8Q3UHI4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmed8Q3UHI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms