Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfgef3Q3UGY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef3Q3UGY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef3Q3UGY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arfgef3Q3UGY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef3Q3UGY8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef3Q3UGY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef3Q3UGY8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef3Q3UGY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef3Q3UGY8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arfgef3Q3UGY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arfgef3Q3UGY8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef3Q3UGY8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef3Q3UGY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef3Q3UGY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfgef3Q3UGY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef3Q3UGY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef3Q3UGY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef3Q3UGY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arfgef3Q3UGY8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef3Q3UGY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef3Q3UGY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef3Q3UGY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef3Q3UGY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef3Q3UGY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfgef3Q3UGY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arfgef3Q3UGY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms