Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2cQ3TLH4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrc2cQ3TLH4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrc2cQ3TLH4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2cQ3TLH4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2cQ3TLH4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrc2cQ3TLH4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2cQ3TLH4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2cQ3TLH4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2cQ3TLH4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2cQ3TLH4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2cQ3TLH4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2cQ3TLH4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2cQ3TLH4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2cQ3TLH4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2cQ3TLH4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2cQ3TLH4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrc2cQ3TLH4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2cQ3TLH4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrc2cQ3TLH4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrc2cQ3TLH4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrc2cQ3TLH4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrc2cQ3TLH4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2cQ3TLH4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2cQ3TLH4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2cQ3TLH4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2cQ3TLH4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2cQ3TLH4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2cQ3TLH4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms