Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc2Q3SXD3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hddc2Q3SXD3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hddc2Q3SXD3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc2Q3SXD3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc2Q3SXD3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hddc2Q3SXD3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc2Q3SXD3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc2Q3SXD3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms