Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BSXQ3C1V8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BSXQ3C1V8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BSXQ3C1V8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BSXQ3C1V8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSXQ3C1V8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSXQ3C1V8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSXQ3C1V8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BSXQ3C1V8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BSXQ3C1V8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSXQ3C1V8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BSXQ3C1V8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms