Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HFEQ30201 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HFEQ30201 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HFEQ30201 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HFEQ30201 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HFEQ30201 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HFEQ30201 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HFEQ30201 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HFEQ30201 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HFEQ30201 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HFEQ30201 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HFEQ30201 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HFEQ30201 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HFEQ30201 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HFEQ30201 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HFEQ30201 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HFEQ30201 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HFEQ30201 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HFEQ30201 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HFEQ30201 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HFEQ30201 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HFEQ30201 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HFEQ30201 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HFEQ30201 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HFEQ30201 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HFEQ30201 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HFEQ30201 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HFEQ30201 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HFEQ30201 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HFEQ30201 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HFEQ30201 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HFEQ30201 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HFEQ30201 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HFEQ30201 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HFEQ30201 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HFEQ30201 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HFEQ30201 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HFEQ30201 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HFEQ30201 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HFEQ30201 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HFEQ30201 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HFEQ30201 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HFEQ30201 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HFEQ30201 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HFEQ30201 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HFEQ30201 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HFEQ30201 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HFEQ30201 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HFEQ30201 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HFEQ30201 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HFEQ30201 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HFEQ30201 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HFEQ30201 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HFEQ30201 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HFEQ30201 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HFEQ30201 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HFEQ30201 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HFEQ30201 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HFEQ30201 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HFEQ30201 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HFEQ30201 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HFEQ30201 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HFEQ30201 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HFEQ30201 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HFEQ30201 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HFEQ30201 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HFEQ30201 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HFEQ30201 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HFEQ30201 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HFEQ30201 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HFEQ30201 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HFEQ30201 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HFEQ30201 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HFEQ30201 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HFEQ30201 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HFEQ30201 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HFEQ30201 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HFEQ30201 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HFEQ30201 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HFEQ30201 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HFEQ30201 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HFEQ30201 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HFEQ30201 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HFEQ30201 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HFEQ30201 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HFEQ30201 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HFEQ30201 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HFEQ30201 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HFEQ30201 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HFEQ30201 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HFEQ30201 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HFEQ30201 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HFEQ30201 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HFEQ30201 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HFEQ30201 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms