Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rspo3Q2TJ95 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rspo3Q2TJ95 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rspo3Q2TJ95 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rspo3Q2TJ95 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rspo3Q2TJ95 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rspo3Q2TJ95 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rspo3Q2TJ95 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rspo3Q2TJ95 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rspo3Q2TJ95 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rspo3Q2TJ95 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rspo3Q2TJ95 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rspo3Q2TJ95 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rspo3Q2TJ95 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rspo3Q2TJ95 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rspo3Q2TJ95 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rspo3Q2TJ95 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rspo3Q2TJ95 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rspo3Q2TJ95 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rspo3Q2TJ95 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rspo3Q2TJ95 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rspo3Q2TJ95 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rspo3Q2TJ95 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms