Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX9

C2orf68, UPF0561 protein C2orf68, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf68Q2NKX9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf68Q2NKX9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C2orf68Q2NKX9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf68Q2NKX9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf68Q2NKX9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf68Q2NKX9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf68Q2NKX9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf68Q2NKX9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf68Q2NKX9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms