Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KNOP1Q1ED39 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KNOP1Q1ED39 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KNOP1Q1ED39 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KNOP1Q1ED39 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KNOP1Q1ED39 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KNOP1Q1ED39 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KNOP1Q1ED39 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KNOP1Q1ED39 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KNOP1Q1ED39 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KNOP1Q1ED39 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KNOP1Q1ED39 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KNOP1Q1ED39 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KNOP1Q1ED39 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KNOP1Q1ED39 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KNOP1Q1ED39 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KNOP1Q1ED39 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KNOP1Q1ED39 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KNOP1Q1ED39 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNOP1Q1ED39 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNOP1Q1ED39 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNOP1Q1ED39 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNOP1Q1ED39 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNOP1Q1ED39 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNOP1Q1ED39 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNOP1Q1ED39 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNOP1Q1ED39 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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