Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GEN1Q17RS7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GEN1Q17RS7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GEN1Q17RS7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GEN1Q17RS7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GEN1Q17RS7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GEN1Q17RS7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GEN1Q17RS7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GEN1Q17RS7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GEN1Q17RS7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GEN1Q17RS7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GEN1Q17RS7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GEN1Q17RS7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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