Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC142Q17RM4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC142Q17RM4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC142Q17RM4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC142Q17RM4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC142Q17RM4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC142Q17RM4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC142Q17RM4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC142Q17RM4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC142Q17RM4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC142Q17RM4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC142Q17RM4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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