Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRY1Q16526 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CRY1Q16526 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRY1Q16526 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY1Q16526 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY1Q16526 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRY1Q16526 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY1Q16526 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRY1Q16526 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRY1Q16526 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY1Q16526 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRY1Q16526 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY1Q16526 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY1Q16526 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms